Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms