Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms