Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms