Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms