Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms