Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul7Q8VE73 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms