Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms