Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms