Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms