Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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