Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc12Q8K2L8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms