Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pkn3Q8K045 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pkn3Q8K045 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms