Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phc3Q8CHP6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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