Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Slc43a2Q8CGA3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Slc43a2Q8CGA3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc43a2Q8CGA3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc43a2Q8CGA3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc43a2Q8CGA3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms