Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ercc8Q8CFD5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ercc8Q8CFD5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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