Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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