Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms