Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln3Q8C5U9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms