Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms