Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trerf1Q8BXJ2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trerf1Q8BXJ2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trerf1Q8BXJ2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trerf1Q8BXJ2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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