Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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