Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms