Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms