Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms