Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pggt1bQ8BUY9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms