Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BPC6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BPC6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms