Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gpc2Q8BKV1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gpc2Q8BKV1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gpc2Q8BKV1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gpc2Q8BKV1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gpc2Q8BKV1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gpc2Q8BKV1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc2Q8BKV1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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