Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp1Q8BJQ2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp1Q8BJQ2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms