Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms