Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms