Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ChfrQ810L3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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