Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npm2Q80W85 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms