Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IfnkQ7TSL0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms