Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrc2aQ7TSC1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms