Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms