Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms