Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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