Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmeff1Q6PFE7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms