Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms