Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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