Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarca2Q6DIC0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms