Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzrn3Q69ZS0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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