Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms