Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Polr2kQ63871 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Polr2kQ63871 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms