Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms