Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sall3Q62255 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms