Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms