Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f1Q61501 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms