Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms