Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3Q60803 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.5 ms